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La agregación se mantiene como la principal fortaleza del proyecto CCI
En el periodo 2011/2012, es muy destacable el refuerzo de la cooperación con la UIMP a través de los avances en la creación del Centro Internacional de Posgrado, el desarrollo de una programación conjunta para los cursos de verano en los llamados "Veranos Excelentes" que cuenta ya con dos ediciones, la participación conjunta en la Fundación Santander Creativa del Ayuntamiento de Santander y, muy especialmente, mediante el trabajo compartido en la pionera y exitosa iniciativa de Cantabria Campus Nobel que tuvo lugar en junio de 2012.
 
Por otro lado, la eficacia de la colaboración entre los socios de CCI se ha refrendado con nuevos avances en la agregación, entre los que destaca la incorporación del Hospital Virtual Valdecilla en junio de 2011.Fruto de esta colaboración es el acuerdo para el desarrollo de prácticas de simulación clínica en el HvV para estudiantes de grado de medicina y enfermería durante tres cursos académicos desde el curso 2012/2013 hasta el curso 2014/2015.
 
También en el área de Biomedicina y Biotecnología, es inminente la culminación del proceso de coordinación para el desarrollo del clúster biomédico en Cantabria. Esta iniciativa supone la implicación de la UC y el IBBTEC  (CSIC), el Hospital Marqués de Valdecilla, el IFIMAV y el Gobierno de Cantabria, lo cual va a representar un hito en la agregación institucional en el ámbito de las Ciencias de la Salud e implica la colaboración de los socios de CCI.
 
Destaca además el fortalecimiento de la agregación en torno a líneas estratégicas como el emprendimiento, que, en colaboración con el Gobierno de Cantabria en el marco de su estrategia regional en este ámbito, así como en cooperación con la Cámara de Comercio de Cantabria, CEOE-CEPYME Cantabria, los Ayuntamientos de Santander  y Torrelavega están sentando las bases de nuevas iniciativas y proyectos orientados a mejorar la capacidad emprendedora del capital humano regional.
 
Para ejemplificar la envergadura de los acuerdos alcanzados en este periodo, se puede destacar la implicación del Banco Santander, a través del convenio firmado en junio de 2011, con apoyo a distintas áreas estratégicas de CCI, entre ellas Banca y Finanzas, colaborando con la UC en la creación del  Centro Internacional de Emprendimiento (CISE) , el Santander Financial Institute (SANFI) y la gestión del archivo histórico del Banco Santander. El SANFI tiene por objeto configurarse como un centro de referencia internacional en la materia, desarrollando tanto actividades docentes como investigadoras y de transferencia.
 
En la misma dinámica, se debe reseñar el trabajo constante de desarrollo del marco de relaciones definidas mediante la firma de convenios específicos de colaboración entre diversos miembros de la agregación para llevar a cabo acciones específicas, como es el caso de la Cámara de Comercio, Caja Cantabria (para la internacionalización docente) o el CIESE como centro de la Fundación Comillas adscrito a la UC. Destaca especialmente la intensificación y diversificación de la colaboración con la Fundación Marcelino Botín en la digitalización del patrimonio de Cantabria, el Estudio integral sobre el Valle del Nansa, o el Máster en Educación Emocional, Social y de la Creatividad creado en 2011.
 
En el caso del Parlamento de Cantabria, como representante por excelencia de la ciudadanía de Cantabria, en este periodo se han concretado los proyectos de colaboración mediante la renovación del compromiso con el CEI y su implicación en iniciativas específicas vinculadas al emprendimiento en el curso 2012/2013 en colaboración con la UC.
Por otro lado, es igualmente relevante el incondicional apoyo del Ayuntamiento de Santander, mediante aportaciones como la cesión de 53.000 m2 para la ampliación del campus, la cesión del suelo para la construcción del Santander Fire Research Center, la licencia de obra de la Residencia Juan de la Cosa y la ampliación del IFCA, la participación y apoyo al proyecto "SmartSantander" y su participación en el Centro de Investigación de Ciudades Inteligentes de Santander (CiCiS), que arrancará en el curso 2012/2013 con el impulso de Ferrovial.